地面已经安装了管道，直铺在地面上的，那有什么办法安装复合地板么?

没办法。
如果是实木地板或以考虑用木龙骨垫高，地板龙骨间距有要求，有过桥之类的有管道就有弯头或连接件，还是从水管的保护来说，前提是水管是走的直边直角，综合成本估计跟找平差不多了。
不论从复合地板要求的平整度来说，另外，必须水泥砂浆找平高过水管最高处才能铺复合地板了，正好可以走在龙骨间距中间